某些人对圣人的反对立场
方济曾使人在遗嘱中写道：「凡人为弟兄们修建的房子，应当由表示贫穷和谦虚的泥上和木材为原料，同时弟兄们的圣堂应是狭小的。」关于「以泥上和木材为原枓」一点，方济的心意是，要将主开始在该处增加弟兄数字的宝尊圣母堂作为模范。他立意使这会院永远是一个模范，并成为提醒现在和未来的弟兄的记念碑。
但仍然有人反对他说，依照他们的意见，以泥上和木材为修建的原料，并不是很好；因为在某些国家和地区，木材比石头还贵。方济不愿意同他们辩论这事，因为他当时患病甚重，濒于死亡，并且真地不久就去世了。不过，他曾令人在其遗嘱上写道：「人们给弟兄们修建的圣堂及简陋的住屋等，倘若不符合我们会规内所许下的至圣贫穷，弟兄们万不可以接受。他们不论身在何处，常应如过路客人、异乡人和流浪者。」
我们这些在他写会规和其它著作时，与他共同生活一起的人们，证实他曾将某些弟兄，尤其是上司们所反对的条文插入其著作中。但这些规条在方济活着时，曾使弟兄们和方济之间，产生了歧见。现在，在他去世之后，却为修会裨益无穷。
但因方济害怕恶表，故对弟兄们的请求，不得不予以让步。不
过，他曾一再声明说：「祸哉，反对我的弟兄们，因为我知道那些规条出白天主的旨意，是为了修会的好处的，即使我委曲求全，俯就了他们的意愿。』
方济也常常多次告诉其同伴们说：「使我痛心和忧伤的，是见到弟兄们所反对的，乃是圣善天主通过我的祈祷和默想，为了全修会现在及未来的益处，而启示给我的教训，因为天主使我确实知道，这些规条和教训，吻合祂的圣意。但某些弟兄们，凭着自身的权威，只仰仗自己的知识，便冒然取消及反对它们说：这些规条应予以遵守，其它的则不必遵守。」
不过，如上所述，方济由于害怕恶表，未曾介入许多事，并俯就了弟兄们的意愿，即使这完全违反了其心意。