公元前六世纪中叶，波斯人崛起，在英明的居鲁士大帝领导之下，于公元前五三九年征服巴比伦。次年发表了有名的居鲁士诏书，对于被征服国家一律采取宽大的政策，让所有流徙的人民和他们的神像，能够被运同各国受永远的供奉。犹太人民也在大赦之列，故得以重新返回故土。
在公元前五三八年秋，耶路撒冷恢复了对雅威的全燔祭，次年的春天开始积极建造第二座圣殿。第五世纪的中叶，厄斯德拉和乃赫米雅两人先后返国，重建了耶路撒冷的城垣，也重振了对雅威的敬礼和犹太的法律。
到公元前三五○年左右，波斯国势惭衰而放松对外控制，犹太地区又变成一个由司祭们统治的神权政府。好景不常，未几西方的希腊又兴。亚历山大大帝以雷霆万钧之势席卷了整个的中东、埃及和印度，建立空前未有，横跨欧、亚、非三洲的大帝国。公元前三二二年，巴勒斯坦地区再次屈服于希腊人的铁骑下，成为希腊疆土的一角。