简惠然神父的传教工作，并非仅限于替黑奴服务。贩奴船往返迦太基纳，至少需要好几个星期，在那空档期间，他便往医院、监狱服务，并且照顾社会里没有关心的被遗弃份子。
有一回档期中，他被派出任耶穌会公学的理家一一有实权的职位，心中老是觉得志忑不安；因为「众仆之仆」最不愿意的，便是拥有掌管同会会友的权力。他纯粹本着「服从」的精神接受委任，并且立即设法成为他应该管理的会友的公仆。他挑选会院最肮脏的地方去打扫，请求厨师给他最讨厌的工作去做，还不断坚持替他所有的属下代劳。指派一心渴望服从的人出任总管，实际上绝非是件适当的工作；所以，他不久便被免除理家的职位，改任其他比较操劳，但亦更合符志趣的事务。
迦太基纳当年吸引许多毫无准备的冒险家，类似近代往南非掘金的游民；他们失败的比例远远超过成功的人数，结果沦为人世间一贫如洗的流浪汉，只好试试看怎样博取来世的报酬。于是，他们到处恳求修会收容，准许他们进会修道。但由于他们晋铎资格方面，绝少可取的地方，最多也只能够在迦太基纳，替他们组织一个辅理修士的团体，委派简惠然神父主持。
不幸，他却是位令人莫名其妙的初学神师：有时候，他极谦逊地殷勤照顾初学生，但突然强迫他们做最艰苦的克己功课，虽则那纯粹是好意催促他们，忠随修德慕善的道路。譬如他会带领他们，手持扫帚、抹布，穿过街道往医院去，要他们在那里非但替病人换床单，还该服侍患传染病的黑奴；通常他又会用只巨型筐子，载满日用物品，套上长扁担，自己背着一端，再吩咐一个不甘心干活的辅理修士槓起另一端，然后飞步开路。上文提过他实践慈善爱德功课时候的超人体力，往往使最年轻、最强壮的辅理修士，也赶不上他的步伐：结果，他在前面一味奔走，根本听不到后面另一端的喘息、讨饶的呼声。最令他们害怕的是，他还多次劝谕他们效法自己，脱下外套给黑奴当垫褥，或者用来遮掩肉的溃烂创伤。
此外，他又经常到监狱探访荷兰和英国战俘。他虽则感觉自己不知如何去劝化回教徒，其实已经吸引过不少的皈依者；说起英国人之中，他至少明确地争取到一名颇有地位的皈依者。
西班牙夺回圣基所及圣嘉达莲群島之后，捉到六百余名英国俘虏。简惠然被邀请到旗舰举祭，并且参加西军招待战俘的宴会：他所以肯接受邀请，原来想利用那次机会，打开一条皈依天主教的通道。
英国人对他有着颇深的印象，坚持向他介绍战争期间，恰巧到那里访问而被虏伦敦副主教。舰长于是提议，倘若简惠然神父不反对的话，大家一起照英国俗例为那位副主教的健康干杯。圣人提醒自己，耶穌基督也曾和罪人饮食过，便爽快地答应下来；他很愿意为着争取人灵，举杯祝贺英国国教的副主教。于是，士兵带领一位白长须的老人进入船舱；三巡过后，副主教以拉丁语请求私下会谈。当他们两人走过一边之后，简惠然意识到那个老人并不高兴信奉异端，便取当天的瞻礼作开场白，提醒「副主教」那天是「位贞女的记念日，且是英国的记念日」。原来圣乌苏拉是当天记念的贞女，她的父亲就是英王圣雷斯；简惠然故意称赞圣雷斯，「是位受人景仰的信仰基督的君主模范」。接着把话题转到圣雷斯和亨利八世的差別，一针见血地说道：「一个人人病诟的君主，他的权力是否就可以压服无数虔诚教天者的见识?究竟圣雷斯以他的虔诚所肯定的教会，能不能是个伪教会?而荒淫无道的亨利所建立的教会，反倒是真正的教会呢?倘若这位君主，除非另创一间教会，否则无法遮掩他的丑陋罪行：那末，阁下本来毋需为他的罪行负责，又何必一定得屈服于他的教会呢?」
老人不禁长叹一声，出乎意料地坦白自承完全由于不甘贫贱，家中又有妻小需要照顾，所以不敢抗议亨利八世的为非作歹。虽然如此，他强调自己临终的时候，会尽量想办法死于天主教教会之內。他流着眼泪请求说：「神父，请你为我祈祷。请你为我热切地祈祷。」
几个星期之后，又到访问圣本善医院的日子，简惠然在那里见一副有盖的舁床，躺着的正是那位副主教。老人虽然很接近死亡的边沿，还能够清醒地记得自己的承诺，最后安眠于天主教教会的怀抱中。许多英国战俘也跟随他的榜样，先后皈依真正的教会。
简惠然到医院的服务分两方面：一是到普通科的圣本善医院，另外则是到专为癞病人设立的拉匝禄疗养院。他在两间医院里，常常满心喜悦地担任最粗重、最肮脏的工作；迦太基纳都知道，圣人独自可以干四十个人的活。每逢他公干外出，隔一段期间方才回到医院的时候，就象什么大庆典的场面，病人都象凯旋而来似地欢迎他。
他所有的传教工作中，最令人钦佩的该数替癞病人的服务。读者中想来不少曾经见过癞病人，能够懂得癲病令人畏惧的地方；我本人第一次在东方瞥见癞病的恐怖面貌，迄今仍有着极深的印象。跟癞病人接触，已经是勇气的考验，而看护他们的伤口，简直需要英烈般的伟大精神。
据说有一次，有位西班矛军官在城墙外碰到简惠然，见他满脸笑容地匆匆赶路，便顺口间间往那里去。他回答说：「我正要到圣拉匝禄(疗养院)，跟那里的穷人开嘉年华会。」军官好奇地在后面跟着直到圣堂门外，只见圣人召集所有还能够走动的癞病人聚在一起，自己拣块石头坐下，开始听他们办告解，同时因为那天气较为凉爽，还拿自己的外套替他们挡风。
癞病深浅分几个不同的等级。最厉害、最难看的只能留在最外面，他们即使在癞病人中，也受其他廟病人的排挤，犹如一般癩病人在社会里受岐视那样。圣简惠然却特意到他们蜗居的洞穴里，专诚找这类被遗弃份子。按照写他传记的作者所说的那般：「细心洗涤、包扎他们的伤口，好象处理最细致的鲜花模样；他轻轻地亲吻伤口，甚至用舌头舔净创伤。不能行动的，他便跪在一旁替他们喂食：见到有人不满意食物的样子，便自己拿起一片放到嘴里咀嚼，借而鼓励残废的患病者努力加餐。」
应该留意的是，谁也不可以因而误认圣简惠然全无感受，或者这般地刻意爱顾天主造化里，感觉上最难亲近的一群人，是毋需多大的牺牲；正相反，下文将指出这一切要求圣人说不尽地那末多、那末大的自制。另一方面，圣简惠然亦不以祈祷、示意而自满，他真正积极实践基督精神，亦即那些既非基督徒又不愿身体力行者，所大声倡言的博爱理想。在减轻可怜的患病者种种苦楚方面，圣人可说是无微不至：他甚至到处乞讨蚊帐布料，又找到一名黑妇帮他缝纫，再亲自替病人挂上；每次到拉匝禄的时候，必定尺可能地携带大批布块、香水、绷带、药品；由于医生都不愿意为癞病人放血，他便想办法找到一些披针，教癞病人彼此互相放血。
圣思定说过：「一颗爱心的震荡，可以引起无数的共鸣」。胆怯的凡人固然只敢远远跟在简惠然身后观看，他却仍旧找到几位业余音乐家，肯陪他到医院里，向他们不敢正面观看的听众演奏一番：想来那几位乐师，也从来没有象在医院演奏那般地专心埋头于乐谱呢!
简惠然访问监狱，大部份的时间都尽量去安慰死囚。他的影响力往往使最凶猛的囚犯，也愿意在宣判的刑罚之外，自动加添他所提议的痛悔补赎。执行死刑的场合里，他又会陪同他们走向刑场，让他们喝几口白兰地壮胆，用他自己的手绢拭去他们额上的冷汗，一步步地踏上绞台，直到吊绳勒紧并扣上他们脖子的时候，他仍然和蔼慈祥地扶着他们站直。
按照教会规律，凡直接沾到执行死刑过程的司铎，除了劝诲、安慰死囚之外，都算犯规一一不合符禁制的行动；「犯规」的人没有特许是不准领受圣秩，即使领过圣秩亦不准执行神职。提出这点的理由，是由于有个简惠然神父的故事，显示法律条文与精神之间，永远存有缠夹不清的现象。传说有个西班牙军官制造伪币，被判火刑。当他在火刑前送上绞台时，不料吊绳挣断；于是，简惠然赶忙扶起死囚，抱着他等候刽子手重新套上第二条吊绳。岂知道第二条绳也经不起拉扯而中断，落下时正好碰到简惠然的身体；在旁的一个迂腐伪君子，顿时大声呼喊说他犯了教规，从此不准执行神职。圣人却冷静地答说：「真的吗?倘若我能够因而拯救一个灵魂，也算是值得的了。」
他的行动看似不符合教规的明文，其实他很清楚教规完全可以保障他；迂腐的人喜欢吹毛求吹毛求疵小题大做，但当时情况根本不可能违反教规，所以圣人声色俱厉地教训伪君子，要他日后勿再无风起浪。接着、紧紧抱着死囚，遮掩着那痛苦扭曲的可怖脸容，直到死囚断气后方才松手。
过后，死囚的狱室里找到一本祈祷书，夹着一页死囚亲笔字条，是在简惠然神父访问后，录下的一句感想：「这本经书是属于世界上，一个最幸福的人所有。」