一、教会分裂的过程：
教宗的充军与教会分裂严重影响教会的统一与形象。教宗额我略十一世去世后，在罗马公民的胁迫下，枢机们选举了意大利米兰的主教为教宗，即乌尔班六世。由于教宗长期定居法国，故罗马处于混乱状态。枢机团的16位枢机有11位是法国国籍的他们不愿意留在罗马，要求教宗重回法国。乌尔班六世严辞拒绝了他们，彼此之间也伤了感情，以致于11位枢机逃回法国，在那不勒斯宣称“此教宗选举无效”。另选教宗格莱孟七世，定居于亚味浓，并得西班牙，苏格兰，法国的支持。德国，英国，意大利支持乌尔班六世，如此出现了两位教宗，两个枢机团，分裂就此造成了1389年乌尔班六世去世。
两位教宗之间相互绝罚，各自拥有枢机团，并各自立教区主教及修会院长。各自吸收年薪，给教会带来了极大的损害。在此教友们要求希望统一，巴黎大学和牛津大学的教授要求召开大公会议来解决此事，但遭到许多人反对，因为教宗是最高的元首，没有人能审判他。所以问题迟迟不能解决。日益严重，终于双方同意召开会议解决。
1409年比萨会议、宣布有审判教宗的权利。并传讯他们，可两教宗拒绝并称此会议无效，大会无法同时把他们开除废逐，并选出新教宗亚历山大五世，希望藉此能恢复教会的统一局面，可事与愿为，成了“三教宗鼎立的局面”，如此出现三个枢机团，教区内有三个主教，修会有三个院长，教会内产生一片混乱。
罗马： 亚味浓： 皮撒会议：
乌尔班六世：1378－1389 格莱孟七世：1378－1394 亚力山大五世：1409－1410
玻尼法爵九世：1389－1404 本笃十三：1394－1415 若望二十三：1410－1417
意诺森七世：1404－1406
额我略十二：1406－1415 （教宗排位以罗马为标准，当今为第264位，召开梵二的是若望二十三世）
二、公斯当斯会议，教会分裂结束。
因教会混乱，德国皇帝西日斯猛为了早日解决教会分裂状态，联合若望二十三世能召开会议解决此问题。于是在1414年在公斯当斯召开大公会议，他希望自己能成为唯一教宗，可遭到枢机们的反对，故而逃跑，被抓回并被废除，同时也把本笃十三世废除，罗马额我略十二世自动辞职，大会重新选了玛尔定五世为教宗，新教宗批准了公会议关于信仰的一些规定，但他拒绝接受“大公会议有直接来自天主的权力，因此教宗也在其权力之下”的观点。
经过39年之后，在玛尔定五世下教会重新恢复了和平与统一。但经过这次分裂，教宗在基督教国家中的地位大受影响。不但在“神权高于俗权”方面，而且人们对教宗在教会中至高无上的权力也产生了怀疑。到底是教宗还是大公会议高。事实上是，只有教宗本人或其代表主持或参加，并由教宗本人亲自认可或批准其决议的大公会议，才被普世教会所接受，所以教宗高于大公会议。教宗自己可以以自己不能错的特恩，宣布某端当信的道理，而大公会议没有教宗的认可不能规定某端道理。
三、异端：祸不单行，充军、分裂严重影响了教会的形象，此时又出现了两个异端。
1、英国的若望威克里夫（1325—1384），神父，牛津大学教授，出名的哲学家，演讲者。主张天主是一切财物的拥有者，世俗君王和教会领袖只是财物的管理员，只有忠心侍奉天主之人才有资格管理天主的财物。因此伦理堕落的神职丧失了拥有财物的权力，理所当然应由世俗权力取而代之。教会只管理精神事物。
西方大分裂之后，他变得更为极端，拒绝教会的一切组织。主张圣经是信仰的唯一标准和人类完美的最高权威。（但他不否认教父和圣师的教导）教会是所有预选者的总合是纯精神性的，基督是身体的头，教宗不是由基督所立，而是君士坦丁所为应废除。他还否认圣体圣事的本质变化，他认为本质变化是不符合逻辑不符合圣经和传统，认为基督的体血临在于面饼中，是象征性的临在和圣事性的临在，面饼和酒是一有效性标记；
其著作及教导起初受到国王、贵族和某些教授的拥护，但随着他的教导在社会上造成混乱，慢慢遭到人们的反对。在1382年的“伦敦会议”上他受到谴责，且取消其在牛津教学的资格，其1384年去世。
2、若望胡斯：（1369－1415）波希米亚人，是神父及布拉克大学教授。因着王室的通婚，所以英国威克里夫的观点传到波希米亚，胡斯除圣体圣事外，其余观点都接受。其主张“每个教友都享有同样的司祭职”反对神职制度，认为教友要兼领圣体圣血，光领受圣体无效。强调基督是教会的唯一元首。他在1415年被处以火刑，他的死亡激起了波希米亚人的民族感情，故而与教会决裂，后加入东正教，他的观点深深影响了后来誓反教的改革，他们也是因着教会黑暗而造成的。
四、大公会议运动：
产生的原因：在西方的大分裂中，教宗没有起到带头改革教会的作用，致使人们感觉到只有召开大公会议来改革教会的弊端，集体领导才能保证不能错的特恩。故而产生大公会议运动。认为大公会议在教会中具有最高的立法权，认为主教，教宗是教会意志的工具，因此应服从大公会议的一切决定，故而大公会议高于教宗。他们的根据是1409年比萨会议产生了若望二十三与1414—1418年的公斯当斯会议选出了玛尔定五世。1460年大公会议运动被教宗比约二世所谴责，绝罚持此匝观点之人。故而大公会议运动逐渐衰退，直至消失。