比约十二世1939——1958年在位。他继位不久之后二战就全面爆发了。他的座右铭是“正义的工作是和平”，表示他要终生为世界和平而奋斗。（他1939年6月份上任，9月1日德国进入波兰，二战正式爆发。）
一、呼吁和平：
1939年9月德军战领波兰，教宗在10月20日发表“Summi Pontificatus”通谕。教宗呼吁人类重新把天主放回他应有的位置，教宗对当时的罪恶表示悲痛，并且把罪恶的根源归于信仰的衰落。人反对不受任何限制的个人主义，呼吁人们通过祈祷和工作使世界重新恢复和平和秩序，但他同时出声明人类的一切努力都必须在天主的法律之下才能生效。
1939年圣诞节，教宗颁布圣诞节文告“恢复和平的五项原则”提出五项建议：
1、在各国中复兴真正的基督教精神。
2、承认每个国家的权利。
3、裁军，削减武器装备。
4、承认少数民族的权利。
5、建立国际法庭，以保证和平。
但无人理睬，教宗既不能阻止战争的浩劫，便想法减轻其灾害，成立宗座救助委员会，帮助伤员和难民。他曾下令将极珍贵的祭器溶化，以便为犹太人向德国交纳赎金。（100万里拉和100万英磅）开放教堂，收容难民，例如仅冈道尔夫一处就收留15000犹太人。他也隐含地谴责德国纳粹的政策与暴行，但他同时相信，公开的富有挑战性的议论是十分危险的。希特勒曾扬言要将宗座赶出梵蒂冈。也正是由于教宗没有公开地谴责德国，给仇视教会的人留下了口舌。
1944年罗马解放后，罗马城犹太人的首席经师、拉比 以色列.伊利亲自向教宗表示感谢，称赞教宗的勇敢，对他在极困难和危险的情况下，拯救众多的犹太人致以崇高的谢意。其本人亦归依了教会。1956后去世。
二、任命新枢机：
教宗为重振战后传教区的传教事业，1946年2月任命了32位新枢机。其中许多来自南美洲和非洲。出人意料的是亚洲也出现一位枢机，他就是生于山东阳谷教区，时任青岛代牧的田耕辛主教。教宗此举不言而喻，他希望战乱之后，借新枢机的任命显示教会的大公性，推动传教区的传教事业。
三、谴责共产主义：
二战之后，从某种观点而言，教会所受的打击和考验比在大战期间更为沉重，其原因便是共产主义的迅速发展。特别是中欧、东欧和亚洲差不多有三分之一的人生活在铁幕之下。（如苏联、爱沙维亚、立陶宛、东德、波兰、捷克、匈牙利、南斯拉夫、阿尔巴尼亚、保家利亚、中国、北朝鲜、越南、古巴等）教会在这些国家所受的打击和迫害极为严重。圣堂被毁或改为它用、学校和慈善事业被没收、神职人员和修女被充军或做牢，甚或杀死。由于共产党的种种倒行逆施，教宗由1949年发表相关通谕，教会谴责了共产主义，并将加入共产党的教徒以及所有助长共产主义势力的人都有开除了教籍。
四、颁布“圣母荣召升天”信条
1950年11月1日由教宗当着36位枢机和450位主教，隆重宣布“圣母升天”为当信之端。教宗同时规定1654年为“圣母年”以纪念“无原罪圣母”信条颁布百周年。
五、礼仪改革：
放宽圣体斋（今日关于圣体斋的规定仍为此）；修改教会的礼仪年和司铎日课经规则；为使教友能参加并了解耶稣苦难的礼仪，规定圣周四、主受难日和复活前夕的礼仪改为下午或晚上举行。