在正式接受心灵治愈祈祷前，通常，求祷者要作两个阶段的准备祈祷。第一阶段的准备祈祷，包括四项因素：第一，接受耶稣作我生命唯一的救主；第二，向耶稣认罪；第三，宽恕自己；第四，宽恕一切得罪过我的人。关于这方面，《心灵的治愈》一书第五十二至六十二页中，已有详尽的讨论。现在，我愿再提一次，有两个理由：第一，当一个人作心灵治愈的经验愈多，愈会体验到这项准备十分的重要；并发现作这种准备祈祷中会有些新的问题。因此，在某几点上，需要清楚加以说明，或更强调其重要性。第二，是因为以前作心灵治愈祈祷，我常对求祷者说，这个祈祷是我说一句祷词，他马上重复这句祷词。但是作了多次以后，我感到相当厌烦。所以，我干脆把要作的祈祷经文写出，让求祷者照着念。现在，我把这段经文抄录下来：
一、接受耶稣作我生命唯一的救主
耶稣，我来到祢面前，把我整个生命托付在祢的手中。首先我感谢祢赏赐了我生命，并爱了我，不断地在过去的生命中引导和照顾我。同时，谢谢祢把信仰赏给了我，使我清楚地认识真理，也感谢祢在信仰中所赐的各种恩惠。耶稣，我感谢祢给我这一切。
我相信祢是降生成人的天主子，祢身为天主，却来到人间，愿意分享人的命运。祢除了罪恶外，过着跟我们人一样的生活，经验人世间各种的状况和境遇，尝遍了各种善事与艰辛。我相信祢能完全了解人内心的感受，因为祢走与人同在的天主。
耶稣，借着祢的苦难，祢消除了人所犯的一切罪过。借着死亡和复活，祢战胜了死亡；并借着洗礼圣事让我们分享了祢的生命及永生的希望，耶稣，我相信祢在光荣升天后，派遣圣神，临在教会内，不断地把救恩赐下。现在我来到祢的面前，接受祢作我生命唯一的救主。我相信普天之下，除了祢以外，没有一个名字可以使我得救。耶稣，我把我过去的一切，不论好或是坏，都交托给祢，并按祢的仁慈和大能，把我过去生命累积的罪恶和其后果中解救出来，让我真实体会祢对我的大爱，并欢欣踊跃地赞美祢。耶稣，我赞美祢、感谢祢。
二、向耶稣认罪
耶稣，祢是我生命唯一的救主，我来到祢的面前，承认我过去所犯的一切罪过，无论它是从前或最近犯的，故意或因软弱犯的，屡次或偶然犯的，现在我在祢面前一一认罪，请以祢的大爱来宽恕我（静默片刻，把心中特别愿意向耶稣认的罪，向祂述说，恳求祂的宽恕）。
耶稣，请以祢的血来覆盖我，使我得以洁净。让我从罪恶的束缚中，得到释放，心灵恢复自由，使我重新跟祢和好。耶稣，祢要求伯多禄宽恕别人七十个七次，我相信祢会完全宽恕我得罪过祢的地方。耶稣，因着祢宽恕之爱，我赞美祢、感谢祢。
三、宽恕自己
耶稣，祢既己宽恕了我，现在我也愿意在祢宽恕之爱中，宽恕自己、接纳自己。耶稣，我明白我是个有缺点、有软弱、有问题、有困难，受过许多挫折和失败，犯了许多罪的人。当我碰到以上种种情况时，我常常不能接受自己。因此，我常常自卑、自恨、自贬、自抑，甚至自我处罚，摧残自己的生命。但是，耶稣，我相信祢爱的就是这个真正的我，是个有缺点、有问题，有罪过的我。耶稣，现在请以祢宽恕之爱来肯定这个真我，并帮助我能真正面对自己，接受我的限制和缺陷，宽恕我所有的过错，用温和的态度来待自己，给予自己一个改过自新的机会，就像祢给了我这种机会一样。
耶稣，请派遣圣神充满我，帮助我用一个正确的态度来面对自己，也在祢的爱中解除我给自己加上的许多束缚；请教导我在祢的爱中成长，使我觉得作一个真正的我是件喜乐的事，也是祢所愿意的，耶稣，我感谢祢，依靠祢。
四、宽恕一切得罪过我的人
耶稣，祢无条件地宽恕了我、接纳了我，请帮助我宽恕那些曾得罪过我的人。现在，我把一切得罪过我的人，和他们曾作过伤害我的事，完全交在祢手里，并因祢的名宽恕他们对我所作的一切。（静默片刻，按自己的需要祈祷。）耶稣，我因祢的名和仁慈宽恕他们，降福他们。我把内心对他们的仇恨、抱怨、愤怒、害怕都释放出来，交在祢的手里，请祢去除它，让我不再为这些消极的情绪所重压。请祢解除我心灵的负担，使我重获心灵的自由；也使我能平安地在天父前祈祷说：「宽免我们的罪，如同我们宽恕别人一样。』耶稣，因祢伟大宽恕的爱，我赞美祢、感谢祢。
以上的经文，我们应懂得灵活运用。因为上面的内容，并不一定切合每人的需要，或这人内心的状况。所以，当求祷者念完一段祈祷词后，我会问他对祷词有没有特殊的感受。如果他有个人的困难，或有不大了解的地方，我就花点时间跟他谈一下困难的所在。假使他有些个人的需要，我就会领他作一个更适合他具体需要和当时心情的祈祷。
例如，求祷者作了宽恕得罪过自己的人的祈祷后，他会告诉我似乎有几个人很难宽恕。这时我会和他讨论他与这几个人曾发生过的事，而现在他对他们有何种态度。倘使他愿意真正宽恕他们，我就带领他作一个特别宽恕这几个人的祈祷。
或许有人会问：接受心灵治愈祈祷前，是否先让求祷者领一次忏悔圣事。按我个人的经验，这要看求祷者内心实际需要而定。有些人是一位很热心的信友，他可能在一、两个星期前，曾领过和好圣事，就不需要让他再办一次告解。可是，遇到某些重要情况，我也会劝他告解。例如，有一对尚未结婚的人，他们愿意婚前请我为他们作心灵的治愈，这时，我先劝他们办告解，再来作治愈祈祷，这样祈祷的效果更好。但有时，他很长一段时期没有领受忏悔圣事，只要在不勉强的情形下，我尽可能地帮助他办一次妥当的告解。
我在这一点上特别强调，对求祷者不应勉强，假如他寻求心灵治愈，这已表示他愿意有某一程度的悔改。当时，若他尚未很深地认识自己的罪，反而在治愈祈祷后，在他与耶稣相遇的经验中，他体会到自己应妥善去领忏悔圣事。事实上，有许多教友，也为人作心灵治愈祈祷，可是，他们无权听告解。所以，因时间和地方的限制，祈祷者无法要求祷者先办告解再作治愈祈祷。这时，祈祷者可带领求祷者作一次很好的悔罪祈祷，等心灵的治愈结束后，再鼓励他找神父办一次妥善的告解。
在我个人的经验中，感到在宽恕自己上有困难的人数最多。这实在与中国传统望子成龙、望女成凤的心理有关。有许多父母不管子女资质如何，从小就很严厉要求子女作好。尤其在联考制度压力下，在幼稚园、小学时期父母就要求子女在功课上，或生活其他方面达到他们定的标准。此种方式中成长的孩子，逐渐把父母的要求内在化。因此，他们在长大後，很自然地会严格要求自己。可是，当他们不能达到对自己的要求时，就严厉指责自己、恨自己、处罚自己。这种态度和行为对他造成了极大的心理伤害，同时，他也不易接受自己的有限、软弱并宽恕自己。
有些小孩，他们的父母或老师要求他们达到目标的唯一方式，就是威胁和恐吓；但从不给鼓励和赞美，来肯定孩子的努力或成就。如此，孩子们长大後，每次面对自己不完满，或失败和挫折之处常无法接受天主会爱他这样一个有缺点的人。他总觉得应靠个人的努力，达到了某一程度的完美之後，天主才会爱他。实际上，这个想法完全相反了耶稣所显示的爱情。耶稣曾很清楚说：「不是健康的人需要医生，而是有病的人；我不是来召义人，而是召罪人。」（谷二17）他们从小所受到的培养，使他们认为除非达到某一程度的完美，才配接受耶稣基督的爱。其实，他们永远没有能力达到这种程度的完美。因而，他们永远不配接受耶稣基督的爱。
此种完美主义，表面上看来好像是美好的，并要求自己努力上进。但是，它造成人对自己、对天主的态度一种很不正确的扭曲；它在人和耶稣基督之间造成一种不必要的隔阂，让自己关在一个很美丽、孤独却是完美主义的牢笼中。他们很少欣赏自己的优点，也不感到自己是可爱的，内心常常感觉有沈重的负担和束缚，无法获得内心的自由。因此，他们常常感到郁郁寡欢。
往往这种人对自己要求的很严厉，批评也苛刻。有时他也受不了这种态度，因此，他更加对别人要求严苛。此种不肯原谅和容忍别人的缺点，使他无法自由地去爱别人。
具有这种完美主义的人，他所依恃的藉口是十分美丽的，因此，很不容易打破由美丽虚伪的外衣下完美主义所造成的壳。有些人的完美主义是这样的深，以至使他觉得如果他放弃完美主义，整个生命的意义都会丧失：这人没有办法面对自己的缺点、软弱，也不给自己足够的时间来成长——不让自己经过挫折和失败的过程，慢慢地走向成功。严格的完美主义，有时要求人一步登天；当他不能一步登天的时候，就极为失望，放弃一切，什么也不作了。
这种完美主义，给他带来极大的重担和束缚，实际上，以自贬、自责摧残生命的活力，使自己变成一个瘫痪的人。
面对完美主义的人，有时很难帮助他们。因为他们有一套美丽的逻辑和幻想，而这是他们不愿轻易放弃的，否则，就必须面对自己的软弱和丑恶的一面，这为他们是受不了的。他们习惯用完美主义为藉口，来掩饰真正的自我：但又无能为力作任何改良。他们陶醉在一个空洞、建筑在沙上面完美的理想中；却无力向这个理想往前一步。他们既不懂得爱，也没有能力接受爱，他们缺乏生命活力的来源，只好以完美主义的理想来自我陶醉、自我掩饰了。
耶稣基督也要求我们完美。袍要求我们成全，如同天父一样的成全（玛五48）。但袍常按人现实状况，爱我们真实的自我。尽管这个我是有缺点、困难、软弱、有罪的，但袍仍爱这个真正的我，呼唤我不断地从罪恶中悔改。袍无条件地愿意宽恕我七十个七次。袍无限的忍耐，只要我肯在悔改的道路上前进，袍就以温和的爱指引我，一步步地往前走。袍给我从悔改到完美之间成长所需要的时间。袍不要求我一步登天，并容忍我在成长过程中有起有伏，甚至失足跌倒。耶稣要求我的是愈来愈忠实，把我整个生活的目标朝向袍，走向袍要求我的完美。不论我走的是怎样的缓慢，袍却凡事包容、凡事忍耐、凡事相信、凡事盼望。
除非一个完美主义的人，可以很真实的体会到耶稣爱他现在不甚完美的自我，也许他逐渐会卸下以完美主义作藉口的掩饰：使他的安全感，不建筑在完美主义的理想上，而是建筑在耶稣对他无条件的爱和宽恕中。可是，要使他作到这一点，常常需要在他生活中，有一个具体的人能接纳现在的他。经由这个活生生的人，他会了解被一个人如此的接纳，当然，主耶稣也可以这样的接纳他。通常来讲，这实在需要一段时间的努力交谈，以及在具体的人际关系中，自己被别人了解和接纳，这时，他才敢除去完美主义的外壳，以真实的自我接纳耶稣基督的爱。
自责、自恨、自我贬抑……并非都出於完美主义，而且完美主义深浅的程度也大相迳庭。因此，当求祷者有这样的问题，祈祷者常需求耶稣基督的引导，看看怎样帮助求祷者放弃他的自贬、自责，和接受耶稣基督的爱。这种实际的牧灵智慧与助人的艺术，不是文字所能表达出来的：必须在人具体的经验中，受圣神的引领而获得。所以，在此我就不多说了。
平常一个人作完第一个阶段的准备祈祷後，他会体会心理上有一些变化，比以前更平安。但也有少数人，在作完这阶段祈祷後，却无动於衷，没有任何的感受。那么，只要没有不好的扰乱，就可进入第二阶段的准备祈祷了。