一八五七年九月，六位马扎传教士由的里雅斯特启航前赴埃及。金邦尼是其中的一员，这也是他的首次传教旅程。他们在圣地稍作朝圣后，便继续前往中非。金邦尼写信给父亲，描述他们沿尼罗河往下走的旅程：在河流的两旁，都是一片辽阔而密密麻麻的原始森林，覆盖和保护了瞪羚、羚羊、狮子和长颈鹿，景色跟加尔达湖大有径庭。传教士花了三个月的时间往喀工穆。然后，他们再要在酷热中度过三星期难受的航程，最终抵达深入南苏丹的圣十字传教站。
在圣十字传教站的工作
这些新传教士着手布置居室。金邦尼在另一封信中，讲述他们的工作。其中一人负责木工，制造一些基本的用具，例如药柜、木盒、餐桌等。一人做菜。另一人洗熨。金邦尼自己则负责裁缝。在他们居住的地方，人们操着很多他们不懂的语言，因此，他们先学习了卡语。他们做了一个简短的生字表，尽力用阿拉伯语来沟通。那时，刚巧是雨季，他们全都患了病。其中的奥利波尼神父去世时，他们在那里只过了六周。奥利波尼垂危的时候，仍对他的同伴说：「即使你们只剩下一人，也不要放弃。天主愿意让这传教站和非洲的皈依继续下去。我确是为此而死。」这番话给金邦尼留下了深刻的印象，并在以后的日子里鼓励着他。
由于雨季的关系，传教士与外界的消息隔绝。最终传到金邦尼的消息，就是他的母亲去世了。他时常称赞父母所作的牺牲，让他成为传教士：他感到再不能要求有更慷慨的父母了。他获悉母亲逝世后，禁不住向其中一位同伴倾吐内心的哀伤，也写信给他的表弟，说：「我既已舍弃了一切，难道天主连这牺牲也要求吗?愿天主受赞美。但是，这使我很心烦意乱：我的母亲去世，现在只剩下父亲独自一人。」
信件亦带来其它传教士相继去世的消息。事实上，这些年来，在沿着尼罗河工作的传教士当中，已有十九人去世。金邦尼与其余仍幸存的，都是身体虚弱和发着烧。因此，一八五九年一月，他们决定放弃圣十字站的工作，返回非洲。
这次北上到埃及的旅程需时六个月。金邦尼在路上，写信告诉一位朋友，他经常发烧，并害着痢疾。「这些疾病使我虚弱得多了，令我感到快要死去。身边的人都劝告我离开中非，至少离开一段日子，然而，这都不是我所愿意的……跟着要做甚么呢?看来除了心悦诚服地接受天主的旨意外，没有别的了。目前唯有回家，等待圣神新的推动。」
金邦尼在非洲刚过了两年，却只花了十一个月在圣十字站工作。尽管如此，十年前，即一八四七年，最先一批传教士前往非洲这一地区时，没有一人能在这样的天气下逗留和工作。所有人都患了热症(疟疾)，但只有很少药物，亦未能治好热带疾病。传教士唯一的通讯和运输工具，就是在河上使用船只，在横度沙漠时使用骆驼。这些工具十分缓慢，例如由苏丹往埃及便需时数月，而且，由于经常受到水灾或旱灾的影响，路线也不确定。这些早期的传教士不能预先作好准备，应付可能遇上的困难。此外，在那时候，对外界的人来说，非洲是一处未探明的地方，他们没可能作甚么准备。他们是先驱。
十字架的经验
金邦尼决定做神父前，曾花了两天，跪在十字架前祈祷。他渐渐明白到，梦想和渴望在非洲工作，意味着自己的生命将充满个人的痛苦和损失。他的父母曾养育八名子女，但其中七人已夭折。明显地，金邦尼是在某程度的下幸和悲伤中成长。在决定成为传教士的时候，他十分关注这为父母所带来额外的痛苦：他们将失去他，也许永远再见不到他。他在非洲写给父母的信里，指出他感到他们的失落，也知道母亲的感受：「我每天是那么惦念着你们，也想着你们给上主所作的牺牲。我永远爱慕你们，感谢你们的牺牲，为我所做的一切。不少人为我们祈祷，但我认为你们所诵念的每一篇圣母经，都更为宝贵，因为它发自一颗为光荣天主而完全奉献自己的心。」金邦尼在母亲死后五个月才获悉时，深深体会到，在现实里，这牺牲对他和父母的意义。
金邦尼立刻回信给父亲。虽然他极力安慰父亲，但字里行间却流露出他莫大的悲伤。一字一句，除了表达出孝心外，也是从心底发出的呼喊、呻吟。他用了三页纸的篇幅，描写为基督受苦是如何伟大，而只有一处提到母亲：「我欢欣雀跃，因为她此以前更接近我。」这封信有很多处显示出，金邦尼明白度基督徒生活和宣讲福音时要受苦。他叙述教会是透过牺牲而成长的。他赞扬天主，因为天主以这方式来眷顾他们。他也承认，「在某些时刻，人性的软弱能使他们陷入深切的哀伤，但我知道，藉上主的恩宠、圣母的助佑以及那些爱我们的人的转祷，我们能从这份哀伤中提升到更超越的思想去。」
从这信的内容看，金邦尼尽力尝试安慰自己。他的信德没有因此而显得薄弱，反而看到他怎样在自己的生活环境中，了解十字架的意义。昔日金邦尼曾默观生命的际遇，今天他也默观这一切。
金邦尼获悉母亲去世前不久，目睹他的同工奥利波尼去世。奥利波尼只在圣十字传教站服务了五周。母亲和奥利波尼二人的死亡令金邦尼领悟到，成为传教士也是一种殉道。
他从失去家庭、母亲和朋友中，经验莫大的难过与哀伤。只有完全经验这哀伤和损失，而不自欺从未发生过，才明白它的意义。
重活耶稣的苦难
金邦尼看到自己的生命重活了耶稣的苦难、死亡和复活，从而领悟损失的意义。他所以能够从各种经历中看到上主的临在，能够宽恕他人、怜悯他人，并非因他否认那发生在他身上的一切，却因他拥抱痛苦，把痛苦跟十字架看齐。因此，在一八六八年，当他的新学院受到强烈的反对，他能写道：「降生成人的天主，用十字架来显示自己的智能，再没有比这更好的方法了。十字架是善人真正的安慰、支持和力量；它造就了伟人，让他们准备，贯彻履行光荣天主、拯救人灵的伟大事工。」
金邦尼能够在其际遇中看到上主的临在：他感到上主与他同在，无论发生甚么事情，都在他的身旁。由于上主临在，十字架也临在。然而，对金邦尼来说，十字架的痛苦并不重要，而是它的力量才重要。如同圣保禄一样，他因基督的十字架而感自豪。这十字架．是从哥耳哥达的高峰涌现出来，然后使整个宇宙充满它的力量，而且能够把中非转变成祝福和救恩的地方……十字架所发出的力量是温柔的，不会毁灭：它降临在灵魂上，并更新它们，好像清凉的露珠。」金邦尼所说的这番话，反映他透过生命的经历，默观复活的主，理解损失和痛苦的意思，并在其中找到交付生命的经验，找到复活。
从他以下所写的说话，我们可看到这种整合：「我经已看到和明白，对我来说，十字架是这样的一位朋友，常常是那么接近，令我总是拣选它作为终生的、永不分离的新娘……我钟爱的新娘给非洲重生的工作带来生气。」因此，金邦尼的苦痛不但为自己，也为他人成了充满意义和生气的。
在复活的主内喜悦
不但受苦的基督临现在金邦尼的生命里，复活的主也临现。透过满怀希望、热爱他人、在周遭环境中保持喜乐、懂得享受人生等，金邦尼在生命中与复活的主相遇。
复活的主让金邦尼充满乐观精神和希望。一八六六年，他写信给他的朋友方济·布里科洛，说：「我对天主充满信心。我确知道，这计划就是天主的旨意。」在喀土穆，一些人讲述他的生平。其中有一位回教徒，名吋赛义德·穆罕默德·塔哈见证金邦尼如何「相信一切事情均来自天主；他是时常信任天主的。」
复活的主也临现在他与人建立的友谊中，他的书信常常表达出一份对人的温情。他叙述其中一位表亲的女儿时说：「亲爱和可爱的埃尔米尼亚怎样?我时常想起她。请代我送给她千万个吻，告诉她，虽然我们相隔两地，但没有使我们疏远。告诉她，多年以来，我一直乐于与她保持一份特别的感情，如某些人一样。我从不后悔一直爱她，即使在这遥远的地方，也因爱她而感到欣喜。」他写给父母的信也充满感情，尤其表达跟他们在天主内合一。他对父亲说：「我的心常常转向你；每天想念你；在工作中也不忘你。天主指引我们的事务，在祂内我们拥有一位好管家，一位忠信的朋友，一位亲爱的父亲。」
金邦尼的书信洋溢他对周遭世界的喜乐。他喜爱所有的圣地、开罗的日常生活、尼罗河沿岸的原野生活，看来好像「令人心醉的伊甸园。」
金邦尼懂得如何保持轻松和享受人生。有一次，有人送给他几瓶酒，他能向对方报告，「为了天主的更大光荣，也祝您和我们健康，以下是我们享用美酒的情况：一、我在开罗的学院与所有的神父一起享用了两瓶。二、一瓶用来跟我们的好朋友、基督修士会的院长一起享用。三、我们在阿斯曼那里误用了一瓶：我们为款待两位方济会士把传教站移给我们，原想给他们开一瓶普通的酒，我们反而用了你送来的其中一瓶。四、我把最后一瓶藏在皮箱里，没有人知道的。我们将于九月十四日在科尔道凡饮用，庆祝耶稣圣心代牧区成立。你可知，如果在中非有幸享用这样的美酒，绝非坏事，简直再好不过了!……我们喝这些酒时，就像享用一些来自另一世界的琼浆玉液!，
因此，透过这些平凡的方式，金邦尼分享复活主的生命。身为传教士，他把这生命留给其它人。