在这黑夜中，人的感官部分和精神都一起得到净化。在走向与天主的结合时，感官还有需要净化的部分，其根源就在于精神。在黑夜中，精神得到涤净，使感官从根本净化。
天主卸除一切精神和感官的、内在和外在的功能、情感和感觉。祂让理智留在黑暗中，让意志干枯、记忆空白，感情陷于极大的困扰、苦楚、烦恼，因为过去灵魂从属灵的祝福中得到的感受及满足，现在都被拿去了。
天主这样做的理由，是要把精神层次的爱，爱的结合，带进一个人的精神之中，并与之结合。天主所用的方法，就是黑暗的默观。天主使用默观的祈祷生活为工具。但这对于理性和感性的功用和能力，却是一种折磨与黑夜。灵魂深切感到自己的贫乏、软弱和可怜。灵魂体验到空虚，而且意识到它的不完美、干枯，并意识到自己缺乏各种理解的可能，觉得自己的心灵被丢弃在黑暗中。理智在信德中行走时，捉不住任何概念性的目标。意志则因发现自己距离事奉天主十分遥远，因而甚感悲伤。在这种状态中的人，从任何教义或灵修指导中，都得不到安慰或支持。在这个时候，如果一位灵修指导向他们解释这种情况，他们会认为灵修指导根本不了解他们。他们会认为灵修指导不明白或没感受到他们的感觉。他们认为没有人能帮助他们或了解他们，因此越发感到悲哀。他们的记忆越发晦暗，因为他们认为他们的苦恼将永无终结。他们感到没有希望。他们一直处在这种状态，直到心灵“变得十分敏感、单纯、升华，能与天主圣神合而为一”。
天主对寻求与天主结合的人都这样做，“那时他才能以属灵的自由之心，神圣地享有天上地下的一切事物”。在这里，圣十字若望讨论到在一个人的心灵中点燃爱火。现在这灵魂能够有所感受，预尝到天主的滋味，然而对其却一点也不了解。
心灵现在体验到“一种热情、强烈的爱”——热烈的爱。这爱注入并在人灵中产生对天主强烈的爱。灵魂已有准备，可接收这爱，他一切感官和理性的能力都无法被任何天上地下的事物所满足。天主已为灵魂预备了所有力量和感官及理性的能力，使它不致于把心力分散到对其他事物的满足上。灵魂现在预备好在造物主天主的爱中提升。这整个过程的目标，是“把灵魂所有的力量、功能和欲求都聚集起来，不论是心灵的或是感官的，而让这个和谐的整体能为爱所用”。这个境界是第一条诫命的满全：“你应当全心、全灵、全意、全力爱上主，你的天主”（谷十二30）。
圣十字若望在他的诗《爱的活焰》中继续发挥。他对这诗的论述也写成一本同名的书。圣十字若望用火焰为隐喻，比喻天主圣神的临在。这火焰具有很强的同化力，能同化与祂接触的一切，使其和祂一样。他把一个人的灵魂比做一块木头。天主之神——爱的活焰，触碰这灵块，即这木头，把木头变化为祂自己。火焰先使在火中的木头干燥，天主之神也这样对待灵魂，直到这木头自身开始燃烧。现在这灵魂燃烧着天主之爱，发出自己的爱之火焰。与神之爱的结合已经产生了。现在爱的活焰已熊熊燃起；灵魂也燃烧同样的爱。两者现在已经结合了。圣十字若望写下这个体验：
啊！爱之活焰，
柔伤我灵至深中心点！
既然现在尔非压抑，
瞬团圆！倘尔意：
撕破此纱甜蜜相遇！
啊！甜蜜烧灼！
啊！欢愉伤口！
啊！温柔之手！
啊！柔巧短触，
永生得当，债务清偿！
经历死亡，尔以生命变化死亡。
啊！火焰明灯！
于尔光辉中，
感觉深洞，
昔隐且盲，
今放光芒，稀极，妙极，
温明同临所爱君王。
何其可爱柔轻！
尔醒于我心，
幽隐尔独居；
尔之甜蜜嘘气，
幸福光荣满溢，
何其温柔，尔以爱情弥我心头！
圣十字若望为诗中的最后一节下了最简短的评述：“我不想谈论这个父子共发圣神的活动，如何以幸福、光荣和天主的柔巧爱情来充满灵魂，因为我深知自己无能为力，如果我勉强为之，必定会辞不达意……圣神藉着这个嘘气，以幸福和光荣充满灵魂，在天主的深处，以不可名状、不可领悟的方式，灼燃灵魂于天主之爱中，愿光荣与尊崇永归于天主。阿门！”圣十字若望简单地表示，天主注入人灵的爱，如此喜乐、深刻、已非言语所能形容。
在《黑夜》一诗中，圣十字若望解释灵魂在黑暗中有一个多么安全可靠的旅行工具。一个人绝不会在路上迷失，除非他依靠自己的意象和概念、知识和感情，过着强迫性的感官生活，或推理的默想。这些力量会阻碍我们获得释放，并且避免错误。一个人的感官和理性能力是善的。是天主创造了它们。这些能力的本质目标也是善的，是天主的创造。天主进入并阻止这些能力运作，好使天主神圣的爱与智慧，成为运作的经验和行动的原则。因此这旅途上的人，灵魂上必须要接受灵性之爱。在这爱中它们更坚强，因为他们在感官和理性能力的黑夜中勇敢地前行而得以操练。当心神自己做了练习并且让自己习惯自己时，他接受天主所赐的神圣之爱的能力就会增长。感官和理性的能力完全处于黑暗中，没有任何的满足，不受妨碍，而且十分自由，就能加入并接受神圣的爱。现在，感官和理性能力不但可以领受神圣的爱，也能成为表达神圣之爱的媒介。
在这里我们可以回到前面所引用的圣十字若望的话，做更深入的探讨。天主这样做，“人才能以属神的自由之心，神圣地享有天上地下的一切事物。”天主使人的能力变弱，并把天主神圣的爱和视野注入一个人身上，只是为了把人的感官、理性和人的能力还给人。然而天主还回这些时，还增加了一个幅度：“自由的心灵”。这自由是注入神圣之爱的直接结果。现在灵魂非常肯定，它最深的中心和它的满全，都与天主旨意合一，不再追求其他的事物。地上一切其他的事物，从天主眼中看去，都只是“其他事物”而已。它们不是天主。正如圣依纳爵《神操》中的“原则与基础”所提的，它们是被创造的，是受造物，应以对受造物的态度来对待它们。所以人与造物主天主结合为一时，就会得到自由。对这世上一切事物，人都是自由的。这是“天主子女的自由”（罗八21）。
对圣十字若望来说，这个过程已深入他的心理情绪生活中，圣十字若望以他默观的祈祷生活为媒介，会晤天主，与天主交往，现在他对一切事物都是自由的。他体验到一种自由，在任何情况下，他都能自由行动。从这个经验，圣十字若望由于他所爱者的“爱的临在“，成为一个深怀着爱及同情的人。
问题讨论
你曾否感到与天主距离很远，即使你很想事奉天主？这时怎样的感觉呢？
你曾否体验过灵修指导的任何解释，都不能使你得到安慰？请与你的小组分享。
你曾否觉得自己的痛苦永远没有尽头？那是怎样的感觉呢？
“天主这么做，是为了在还给我们一切时，我们得到自由”，这是什么意思呢？
当我们的能力一无所用，天主赐给我们神圣的爱，你有过这经验吗？请在小组中讨论。