未能在联合国公开演讲《白皮书》的内容，至少在舆论界看来是方济各会和信理部胜利了。然而，他们却担心将来受到历史的批判，因为按照他们的逻辑：他们总是为了比约神父的利益而行事，或许这一点应该有书面为证。因此，他们想要求比约神父作出澄清。面对这类的语气，任何人将无话可说。于1964年12月14日，比约神父写了以下的声明：
长期以来，媒体经常报导我的情况：似乎我在遭受教会当局的限制和迫害。在天主前，我深感有必要且有义务说明：这些消息是错误的，而且我享有尽职的自由，并未遇到任何敌人和迫害。相反的，我很高兴公开声明：在修会长上和教会权威身上，我得到理解、安慰和保护。除了天主以及他合法的代表外，我不需要任何其他的支持。
以上所写乃出自真理和正义，为使人灵和教会不受损失。我全心所追求的只是众人的利益和天主的光荣。
此声明很快被媒体争相报导，它在历史中将扮演“辟谣”的角色以否认对比约神父的迫害。其实，它是没有多少价值的，因为比约神父只是抄写了他人已准备好的文件，这是克来孟神父于比约神父去世后所写的长篇回忆录中所透露的。
于1963年８月，克来孟神父被任命为福贾会省的宗座代理会长，有关会士良好的品德，尤其涉及到罗同道团体的，他应直接向圣座负责；另外他应监督本会院对1960年马加利主教所颁布禁令的严格遵守。
比约神父不太喜欢这位同会弟兄，这是克来孟神父本人承认的。他在回忆录中坦诚地写道：由于圣部的命令我必须调离欧比神父，他多年来一直照顾比约神父。比约神父很不高兴这一安排，但他明白其中原因。生病的他，几乎不能移动，时时需要他人帮助，即便在起居饮食等最基本的行动方面。欧比神父最合他的意思，比约神父很信任他，换另外一人当然不容易适应。可能正是为此，有一天他对我说话很严厉：在问过我为什么来罗同道之后，他表示有很多话想说，但由于其他会士们在场，只得缄默。随后他补充说：每次我去罗同道都会令他很难过。
要求比约神父发表“辟谣”声明的主意始于1964年１月，克来孟神父于1969年的回忆录中写道：1964年１月３日，我代表总会长要求比约神父对外界的攻击进行有力的干预，为保护方济各会的名誉。他回答说十分乐意，如果让他得到自由。“我只愿意像其他任何一位会士那样”，他说。随后他要求对此颁布一份权威性的文件，以向那些毁谤者证明。
比约神父的回答已肯定了他所受的迫害：他感到屈辱和虐待，因此他才要求能像其他任何会士一样。他之所以要求一份“权威性的文件”以求解放，不然，他做出与事实相反的声明是不会有什么效果的。
克来孟神父未再坚持，直到年终圣部又再次提及此事。“12月11日晚上，在奥达尼枢机的办公室召开了一次会议，决定有必要请比约神父做出声明。”当晚，圣部的秘书连夜准备草稿，而次日便交给了克来孟神父。“12月12日，圣部秘书将由奥达尼枢机写成的文稿拿给我，并委托我去找比约神父完成使命。”
克来孟神父离开罗马，于12月14日到达罗同道。“在教堂的更衣室内，我将媒体、尤其鲁那多等人对方济各会不利的言论，告诉了比约神父，并且以奥达尼枢机的名义要求他为修会和教会的利益而行事。比约神父立即答应：‘若您给我写好，我很乐意签名’，他说。那时我读了早已由圣部秘书写好的声明，而比约神父随即签了字。”
事实上，比约神父别无选择，因为这一签字是以“奥达尼枢机”要求的，并且是为了“修会和教会的利益”。后来比约神父也向朋友们透露，他当时是被逼无奈而签字的。
圣部也以同样的方式使比约神父立下了遗嘱。那是在1960年10月４日，马加利主教视察后的两个月：
我，比太止那的比约神父，原名方济弗哲，特借此遗嘱说明：建于罗同道的慰苦之家的一切财富，包括动产及不动产、属于团体或因前任教宗比约十二世恩准直到我去世属于我个人的，皆由圣座以法人身份继承，为保证慰苦之家继续发展。
比约神父将写好的遗嘱交给了慰苦之家的负责人保存。圣部知道这一遗嘱的存在，但未曾见过，于是，在1964年又拟定另一份遗嘱，内容基本相同，只是更具体地指出一切财富将在其死后归属梵蒂冈的教会事务部。下面的签名是：比太止那的比约神父，方济弗哲；1964年５月11日，于罗同道。
那些年，除了这些内心的痛苦，比约神父随着年龄的增长，身体几乎支持不住了。他生命中没有一天不受苦的。年老的他，又患了支气管哮喘、经常性的剧烈头晕，有时使他跌倒在地，甚至一连几天躺在床上不能做弥撒。
1959年，比约神父患了一场严重的病：４月25日卧床不起，医生们感到惊慌。６月２日，病势加重，医生们进行了第一次会诊；６月30日再次会诊。结论是：患了肺部恶性肿瘤，因此他只有几个月的生命了。因此他的病情日趋严重。于８月若不是超自然的干预，他奇迹式的痊愈是无法解释的。
马桑――一位耶稣会的神父这样描述：那个时期我带着法蒂玛圣母像周游世界，我们是于４月25日来意大利的，正是在那天比约神父病倒的。８月５日，我们来到福贾，从那里要启程去本温多市，但该市年老多病的主教要求推迟几天，理由是人们都出去渡假了，无法举行隆重的庆典。因此我们决定多在福贾停留几天，而因此有机会去罗同道。
我们知道８月10日是比约神父的晋铎周年日，在罗同道会有众多的朝圣者，我们定会受到群众热烈的欢迎。
８月５日晚上，我们到达罗同道，人们蜂拥着跪在圣母塑像前为病重的比约神父祈祷。次日上午十点钟，运载圣母像的直升机驾驶员、汽车司机、几位传教士和我，一起去比约神父的房间。照顾他的会士要求我们尽量别打扰他。我们看到他正蜷缩在床上，冒着大汗、昏迷不醒的样子。我说道：“神父，请祝福我们，也请对前来向圣母祈祷的群众说句话！”
比约神父使足力气，用微弱的声音回答：“愿天主祝福你们，使能为教会和意大利的好处而工作！告诉人们实践圣母对他们的要求！”
约中午，当教堂中人数渐少时，比约神父被担架抬着来到法蒂玛圣母像前，因为他也想看看圣母。静默祈祷了一会儿后，便又被抬回房间。
14日，我们离开罗同道。飞机升起后，我要求驾驶员绕比约神父的医院上空飞行两圈，然后径直飞向福贾。我们离开罗同道一段距离后，突然觉得受到比约神父奇妙而强烈的吸引，似乎他又在招呼我们。于是我对驾驶员说：“转回去，飞到会院上方！”他接受了要求。飞机停在会院上方几十秒钟的时间，我知道下面正对着比约神父的房间。以后比约神父对我说：“当他听到直升机的响声时，便这样祈祷：‘圣母玛利亚，当你来意大利时，就让我病倒了；现在你要走，还留下我这样吗？’”
话音刚落，比约神父的全身就像中电一样剧烈地颤动几下，会士们很害怕，以为他要死。这一奇异的现象持续了几秒钟后，比约神父突然好转了：他的脸色泛红，呼吸也平稳了，并已不觉得疼痛且感到恢复了体力。随后当医生们前来检查时，竟连丝毫病的痕迹都未找到。次日，比约神父便开始在教堂做弥撒并听告解。
比约神父在８月13日写给一位神子的信中，他承认自己奇迹式的痊愈是由于法蒂玛圣母的转求：“请为我感谢童贞玛利亚，正是在她离开那天我好转的！”
并非这次奇迹式的痊愈彻底恢复了比约神父的健康，只是他可以重新工作，而病苦仍在继续。
1962年，比约神父的视力出现了问题，于是被豁免了诵念日课的义务。几年后双腿行动不便、膝盖和脚踝等关节产生刺心的疼痛，因此于1966年获准坐着举行弥撒。1967年由于双腿不能行动，不得不以轮椅代步。
最后那些年，他同样受着精神的折磨，经常受到魔鬼的骚扰。如1964年7月5日到6日的夜里，从他的房间传出一种响声。会士们赶去后，发现比约神父躺在地板上，额头已摔破。一天，他对伺候他的会士说：“魔鬼一秒钟也不让我安静！”另一次，被魔鬼惊吓之后，他对莱肖神父说：“如果你看到我所见的，你会被吓死！”