背景：
战争的发生与结果，主要由二个因素所促成，那就是帝国主义的殖民扩张和清政府的腐败无能。战争的结果是一系列不平等条约的签订。
15、16世纪的欧洲各国，科学技术讯猛发展，国家日益富强。英国18世纪的工业革命使资本主义迅速崛起。19世纪英国已超过西班牙、葡萄牙、荷兰等国成为最大的殖民国家，向外扩张是一种必然的结果。
这一时期的中国确与本方相反，明末清初以利玛窦为首的传教士将西方先进的科学技术连同福音一齐带到中国，再加上康熙热爱科学，国势强盛，后因着禁教运动，西方的科学也随之放弃，国势日衰，道光年间又回到了封建迷信时代。社会发展出现了倒退，丧权辱国是必然的。
一、 禁教的解除
1、《南京条约》
1840年第一次鸦片战争，1842年签订《中英南京条约》，赔银2100万两，开放广州、厦门、宁波、上海、福州五处为通商口岸，割让香港。允许外国人在通商口岸自由经商与传教。
2、《黄浦条约》
1844年中法签订《黄浦条约》，道光皇帝正式批准废除禁教令，允许信教自由，但还不能在内地传教。
3、归还教产
1846年道光皇帝宣布归还被占用的教会房产。
4、《天津条约》
中美、中法《天津条约》：1858年签订，从此天主教会正式获得传教自由，传教士可在内地自由传教。
5、《北京条约》
1860年的《北京条约》皇帝下令可以信教；惩办迫害教会的官吏；赔偿教会房产。传教士可租买土地，建立教堂，教会获得传教信教的完全自由。恢复了教会的正常生活。同时，法宣布对中国有保教权，在这之前葡萄牙的保教权被教宗废除。
总结反省：
从1717年禁教到1844年允许信教为止共有127年，如果到1858年自由传教则有141年。期间教难的长短、严重程度，完全在于皇帝的旨意和法令。这与罗马三百年教难的情况非常相似。但不同的是罗马三百年教难后天主教成国教，而中国教会历经百年教难之后，仍处于受歧视的地位，其原因是中国的统治者未能接受教会。
最不幸的是传教士借英法等国一系列不平等条约在中国获得传教的自由，这给教会蒙上了一层阴影，人往往把西方强权势力的扩张殖民和教紧紧地连在一起，这给日后不断出现的教案埋下了种子。因不平等条约的签订传教士在中国由受迫害者成为受法律保护者。我们不否定大多数传教士是为人灵的利益而到中国，但有个别的传教士传教方面态度欠佳，借外国势力干涉中国事务，给当地人民造成了很坏的影响，不断激起地方上的冲突。我们可以得出这样的结论，道光皇帝之前中国教会所受到的迫害是官方教难，从咸丰帝开始，中国教会所受的苦难是由于民众对教会不满而产生的教案。
二、教案的发生：
外国传教士在中国的地位越来越高，外国人的事当地政府无权过问，由外国领事处理；信教中人不少为吃教之人，信教只是一个幌子；再加上外国势力强迫清政府赔偿大量金银等所有这些往往引起民愤。他们对外国列强无能为力，于是便把愤怒投射到神职人员和教友身上。从19世纪后半叶开始，各要教案此起彼伏，大小共有400 余起。
1、天津教案：
1870年天津流行瘟疫，仁爱修女会所办的孤儿院中，婴儿死亡率较高。于是谣言四起，控告修女挖小孩眼去做药，成千上万群众开始焚烧教堂和孤儿院、杀神职与修女，此次事件中共有10位法国修女、神父和9位其它欧洲人士被杀害。
2、山东巨野教案：
1897年山东巨野（德国圣言会传教区）爆发教案，许多德国神父被杀。后果德国出兵，结果是德国租借青岛与胶州湾99年。
同一年，北京大学成立（由丁韪良牧师任第一任校长）。
三、太平天国之乱
洪秀全从广西桂林开始掀起农民起义，并于1859年攻占南京，1864年失败，共14年时间，给清政府以致命打击同时也给教会带来沉重灾难――拆毁教堂、屠杀传教士和教友。更为甚者，他们随意抄袭解释基督教教义，以致令清政府把天主教和他们视为一丘之貉，给教会蒙上不白之冤。
四、教宗良十三与中国
经1858年的《天津条约》和1860年的《北京条约》，中国教会的传教事业完全置于了法国的保教权之下。这保教权与葡萄牙的保教权不一样，葡萄牙的保教权是双方协商的结果，而法国的保教权则是强要的。罗马教廷想自由地派遣传教士来华和管理中国的传教事业，于是就产生了和清政府建立外交关系的构思。1885年教宗良十三和当时的皇帝光绪互通了书信，但遭到了法国的强烈反对。因为他不愿丧失在中国的威望，他威胁教宗声称如果与中国建交，则没收法国教会的一切财产并禁止法国人外出传教，这一计划遂破产。驻华大使改期上任，实是无期。
五、教务的进展与传教的方法
1、修会的情形
鸦片战争以后，中国的教务经百年迫害再次蓬勃发展起来。
道明会在福建一带
遣使会（1625年由味增爵所建立）：江西、浙江与河北
方济会：山东、山西。陕西、湖南、湖北
巴黎外传教会：四川、贵州、云南
耶稣会：上海、江苏与河北
19世纪末期也有新兴修会到中国传教
圣母圣心会：1862年由南怀仁在比利时创立，1865年到中国传教，1868年南怀仁死于蒙古
圣言会：德国神父杨森在荷兰建立，主要在中国山东和新疆一带传教
此外还有熙笃会和圣衣会等。
2、传教方法
教会在19世纪后半期，在传教方法上一改以前的做法。以前的传教士往往在朝廷中任职（钦天监100多年由会士管理）在大城市中传教。19世纪后半期传教士取得了在任何地方传教的自由，他们开始注意到贫民的悲惨生活，兴办学校、医院、孤儿院等慈善事业。耶稣会士在上海的土山湾和河北献县开办了印刷馆，出版教会书籍，同时也编印字典、翻译或重印古典文学和著名学者的著作。为中国的教育事业做出了重大的贡献。
六、义和团（Boxing Reblling）的倡乱
中日甲午战争（1894－1895）中国战败，签订《马关条约》中国向日本赔银2亿两，割让台湾与彭湖列岛，再加上德国租借了青岛与胶州湾，于是俄、法、、等国家要求利益均沾，掀起了瓜分中国的狂潮。
中国遭受这样大的耻辱，朝野上下受到很大的震动再也不能不奋发图强，于是便有了1898年的“百日维新”无奈以西太后为首的保守派唯恐失落大权反改革，对维新人士大加迫害，发到了“戊戌政变”光绪帝被囚，以谭嗣同为首的六君子被杀，康有为逃往国外。这一连串不幸事件，激恕了慈禧，她把这一切仇恨教放在了传教士身上。此时山东义和团兴起，提出了扶清灭洋的口号，于是西太后不顾李鸿章等大臣的极力反对下令起用义和团欲借机打击列强，于是义和团从山东奉旨进京，一路烧杀抢劣无恶不作。
他们先后在山东、山西、内蒙、辽宁、吉林和黑龙江等地任意横行，大量教堂、医院、慈善机构被毁，大批传教士及教友被杀，例如在献县一次就杀死教友4000人，摧毁616教堂座、学校383座。到京后，20万义和团围攻北堂一月未成功。
此次倡乱中，有4位主教、31位神父和3万教友遇害。教宗比约十二（1939－1958）分别在1946年和1955年将在这次灾难中致命的主教、神父、修女、教友86人列为真福品。