“神学之争”之后教会平静了四十年，又开始了关于基督性体和位格的争论称“基督之争”共出现三个异端：聂斯多略异端、基督一性论、基督一意论。
一、斯多略异端：主张“二性二位”(two nature two person)
他是安提约基亚的一个隐修士，公元428年当上了君士坦丁堡的总主教。宣称基督有两个位格，二个性体，一为天主性、另一为人性，所以称圣母为耶稣之母。故不能称为“天主之母”。亚历山大里亚的主教圣济利禄开始反击，聂斯多略借助皇帝；济利禄则借助教宗（CELESTINE）塞来斯定一世，谴责了聂斯多略，要济利禄负责，可聂斯多略不满。通过公元431年厄弗所大公会议，把他开除教藉，放逐安城，死于公元451年。人死后学说依仍兴盛，公元1556年，部分异端者回归教会，今加色丁礼天主教会。
二、基督一性论：（one nature person）
欧迪克为反对聂斯多略异端，主张耶稣的人性被天主性吸收，只有天主性没有人性，佛雷维翁（FLAVIAN）（君士坦丁主教）遣责欧迪克之主张；另一亚历山大主教迪奥扫禄斯与欧迪克一起反对佛雷维翁。皇帝奥陶西二世在公元449年厄弗所召开了会议，他们两人把佛雷维翁开除教藉。教宗LEO THE GREAT良一世 称此会议为强盗会议。宣布无效，并把其两人开除教藉。当时皇帝玛森于公元451年召开了加采东会议，会议制定了三个内容：1、耶稣基督是两性一体（位）是真天主也是真人，二性结合于一位时，没有改变，没有混淆，没有分离；2、关于教宗首席权问题；3、强调前三届大公会议的正确性。可悲的是许多非希腊礼的东方教会不赞成此大公会议的决定，而分裂出去。如埃及科普提教会、亚美尼亚教会、叙利亚教会、埃第约比亚教会，仍不承认基督两性一体。他们被称为“东方教会”这是教会的第一次大分裂。
三、“三章”和第五次大公会议：
由于“一性论”问题仍未得到解决，直到犹提安（JUSTINIUS 527—565年）下了许多命令：1、THEODORE OF MOPSOUESTIA；2、THEODORET OF CYRRHUS；3、BISHIP IBAS ＯＦ ＥＯＬＥＳＳＡ。“三章”是他们三人的著作，写于４３１－４５１年之间。被人认为有聂斯多略色彩，皇帝犹提安为了讨好他们，而遣责之，并定为异端。得到了东方主教的同意。当时教宗（ＶＩＧＩＬＩＵＳ）认为皇帝如此做是干涉教会内政，拒绝签字，犹提安就把教宗监禁三年，最终被迫签字。这却引起了西方教会的抗议，最终教宗VIGILIUS表示签字无效。最后JUSTINIUS与VIGILIUS商议召开大公会议解决此问题，于公元553年，君士坦丁大公会议（第五次大公会议）由于JUSTINIUS态度不好，教宗未参加，会议结果仍把三人定为异端。教宗VIGILIUS拒绝不承认，皇帝就把他放逐，教宗为防止皇帝认命教宗而同意了此次大公会议。
四、基督一志论（one well person）和第六次大公会议：
公元610年，君士坦丁宗主教SERGIUS，基督一志论由他发起，在耶稣基督内，只有一个意志，为挽回埃及、叙利亚的一性论，以耶京总主教SOPHRONINS为首反对SERGIUS，认为与基督一性论是一样的，只是说法不同，从而引起争论。最终召开第六次大公会议，君士坦丁堡第三次会议（公元680年）。宣布：耶稣有两个意志，人性意志服从天主圣子的意志，但二者不混淆，也不冲突。把“一致论”者绝罚。经过前六次大公会议定论：“天主圣三”与“基督二性一体”的奥迹。
从此结束了东方教会长达３５０年关于信理方面的争论。