圣加大利纳瑟纳有26篇祈祷文遗留后世。很有可能，这些祷文都不是出自她的手笔，并且亦非由她口授。而是当她大声祈祷时，由她的某个追随着记载下来的。所有这些祷词可追溯到她生命的最后四年间。它们以其朴实的文风，对上主天主的赞美和感谢，拯救众人的永恒的愿望深深打动了我们。这些祷文具有坚固的神学理论基础，以基督教信仰的伟大真理为指导思想。有意义的是，我们看到贯穿《对话录》及《书信》之中的主题又出现在《祈祷文》中，被采用为加大利纳与上主之间对话的内容。著名道明会神学家伊天、刚戈指出，她的《祈祷文》中的神学意识已发展为成熟的神学理论。
《祈祷文》明显表明，圣加大利纳是一个伟大的代祷者。祈祷内容都是关于她向上主热情而急切地祈求为所有人行善；人类、教会、教宗、她的朋友、她的同会会员、她本人，及有需求的一切人。显然，她并不把代人祈祷仅只当作为某个人在他处于困境时向上主做的一次过之即忘的祈祷，而是她对于上主和对于邻人的始终如一的爱的表现。在圣加大利纳一生中，她与上主的契合和对他人的关心日益增长，于是便更多更经常她投入到代祷的事业中。
以下祈祷辞是唯一一篇圣加大利纳亲手记录的：
神圣的主啊！进入我的心内；因祢的威力将它牵引到你那儿吧，我的主。赐给我祢的爱和对祢的敬仰。保护我，基督，免受一切罪恶思想的侵袭。以祢高贵的爱，温暖我，再次点燃我的热情，使得一切痛苦对我都变得微不足道。我神圣的父，我良善的主啊，在我需要的任何时刻帮助我吧，我摰爱的基督！我敬爱的基督！（《祈祷文》25）